El primer sacerdot de la capella particular de la casa Bonmatí va ser Mn. Ramon Domingo, l’any 1898, que va caure malalt al cap de poc i va morir a l’edat de 27 anys.
El van substituir els següents sacerdots (entre parèntesis consta el període durant el qual van ser a la Colònia):
Salvi Cateura (1899-1912): Nascut a Tordera el 1869, fou vicari de Sant Jordi Desvalls i Lloret de Mar. Després de Bonmatí va ser rector de Sant Andreu Salou i Torrent. Va morir afusellat el 7 de desembre del 1936 al terme de la Pera. Va exercir com a primer mestre de la colònia.
Artur Rovira (1912-1915): Nascut a Cabanes el 1883, va ser vicari de s'Agaró i capellà de la Colònia Bonmatí, d’on va passar a la parròquia de Vilabertran. El 8 d’agost del 1936 va ser assassinat dins el terme de Vilafreser.
Blai Capdevila (1915, un mes): Nascut a Olot el 1872, va estar adscrit a la parròquia del Mercadal de Girona i després de Bonmatí va ser rector de Cruïlles. Va morir el 1918.
Antoni Auseller (1915-1916): Nascut a la Cellera el 1878, va ser vicari de s'Agaró, Maçanet de Cabrenys, Mieres, Sant Julià del Llor, Tossa de Mar, Begur, Castelló d’Empúries, Calonge, Malgrat, Pineda, Llers, Blanes, Sant Feliu de Guíxols i Canet de Mar, i rector de Vilavenut, Sant Martí Vell i Llampaies. Va morir el 1953.
Jaume Recasens (1916-1927): Nascut el 1879 a Arbúcies, va ser vicari de Cadaqués, missioner diocesà i després de regir la colònia va ser rector de Borgonyà i d’Arenys de Munt. Va morir el 1955. Durant la Guerra Civil es va refugiar al Molinot.
Arseni Griera (1927-1932): Nascut a Olot l’any 1891, va ser vicari de Vilaür, Santa Pau, Camprodon, Santa Coloma de Farners i Calella de la Costa. Va ser responsable de la parròquia de Gaserans però, per manca de salut, va passar a viure a Bonmatí, on va exercir de rector fins que el 1932 va tenir un atac de feridura i el va substituir el seu germà, mossèn Martí. Va ser assassinat dins el terme de Fornells de la Selva el 7 d’agost del 1936.
Martí Griera (1932-1936): Nascut a Olot el 1896, va ser vicari de Palamós i Lloret de Mar i responsable de la parròquia de Montcal. Va morir assassinat juntament amb el seu germà el 7 d’agost del 1936.
Joan Pararols (1939): Nascut a Mieres el 1868, va ser vicari de Maçanet de la Selva, Arbúcies, Sant Joan les Fonts i rector de Sant Climent d’Amer i Constantins, d’on va passar a la Colònia Bonmatí. Va morir el 1946, ja jubilat i adscrit a la parròquia de la Catedral de Girona.
Miquel Janoher (1941-1956): Nascut a Castell d’Aro el 1905, va ser vicari d’Albanyà, Garriguella i Cassà de la Selva, d’on va passar a Bonmatí. Va promoure la processó de Corpus, el Cor Parroquial i va ser l’animador de la visita de la Mare de Déu de Fàtima.